植物內(nèi)含子進(jìn)化模式研究.pdf

1、福建農(nóng)林大學(xué)碩士學(xué)位論文植物內(nèi)含子進(jìn)化模式研究姓名：金谷雷申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別：碩士專(zhuān)業(yè)：作物遺傳育種指導(dǎo)教師：吳為人20070401福建農(nóng)林大學(xué)碩士論文摘要內(nèi)含子是真核生物基因組中重要的組成元件，關(guān)于內(nèi)含子的起源、進(jìn)化動(dòng)力和變化機(jī)制的爭(zhēng)論已經(jīng)持續(xù)了2 0 多年，然而我們對(duì)于這些問(wèn)題的認(rèn)識(shí)仍然有限。進(jìn)入基因組時(shí)代后，大量的基因組序列信息推動(dòng)了內(nèi)含子研究的進(jìn)展，但是植物內(nèi)含子的進(jìn)化的研究才剛剛開(kāi)始．本研究對(duì)不同植物物種的內(nèi)含子進(jìn)行了大規(guī)模的分析，

2、并的到如下的結(jié)果：1 、 通過(guò)分析3 2 個(gè)植物物種的內(nèi)含子位點(diǎn)和長(zhǎng)度信息，發(fā)現(xiàn)植物內(nèi)含子的平均長(zhǎng)度通常較短，即便在基因組巨大的物種中內(nèi)含子的平均長(zhǎng)度仍然比動(dòng)物的內(nèi)含子長(zhǎng)度短，藻類(lèi)和高等植物有著明顯不同的內(nèi)含子密度．2 、 通過(guò)新的內(nèi)含子獲得丟失分析算法，發(fā)現(xiàn)整個(gè)植物界內(nèi)含子的獲得率較低，同時(shí)以數(shù)量減少為主，個(gè)別物種出現(xiàn)較高的內(nèi)含子獲得率。此外通過(guò)分析1 2 個(gè)不同植物物種相互之間的內(nèi)含子位點(diǎn)的保守性，發(fā)現(xiàn)在高等植物的基因組內(nèi)內(nèi)含予位置

3、保守，部分內(nèi)含子位點(diǎn)與藻類(lèi)內(nèi)含子位點(diǎn)相同。這些結(jié)果表明在植物祖先的早期進(jìn)化過(guò)程中新內(nèi)含子大量出現(xiàn)，在藻類(lèi)中發(fā)生了大量的丟失。3 、 為了解內(nèi)含子長(zhǎng)度與內(nèi)含子丟失所受到的進(jìn)化動(dòng)力和選擇以及基因表達(dá)對(duì)其的影響，我們分析了基因表達(dá)量和表達(dá)寬度于它們之間的相關(guān)性，發(fā)現(xiàn)內(nèi)含子長(zhǎng)度和丟失是受不同的因素影響的，兩者相對(duì)獨(dú)立。4 、 進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn)，在水稻和擬南芥旁系同源基因中內(nèi)含子的變化速率要高于物種間的同源基因的內(nèi)含子變化，內(nèi)含子丟失和獲得比率近似