中國(guó)鮡科魚(yú)類分子系統(tǒng)發(fā)育和石爬鮡屬物種有效性的研究.pdf

1、簡(jiǎn)要回顧了分子系統(tǒng)學(xué)的基本原理、研究方法、分析流程和系統(tǒng)發(fā)育分析方法等,以及多變量形態(tài)度量學(xué)特點(diǎn)與應(yīng)用、鮡科魚(yú)類系統(tǒng)發(fā)育研究進(jìn)展,從而有助于理解該研究的方法、目的與意義.鮡科(Sisoridae)隸屬于硬骨魚(yú)(Teleostei)、鲇形目(Siluriformes),由Regan于1911年建立.鮡科共有20屬,50種以上,在中國(guó)有12屬.有關(guān)此類群的分子系統(tǒng)發(fā)育的研究還很貧乏,一些物種的分類還存在較大爭(zhēng)議.選擇鈍頭鮠科(魚(yú)央)屬(Li

2、obagrus)魚(yú)類的金氏(魚(yú)央)(L.kingi)和擬緣(魚(yú)央)(L.marginatoides)作為外類群.通過(guò)PCR技術(shù),擴(kuò)增了長(zhǎng)度為532bp的金氏(魚(yú)央)和擬緣(魚(yú)央)以及長(zhǎng)度為534-542bp的11種鮡科魚(yú)類(31個(gè)樣品)的16S rRNA基因片段.比對(duì)得到550個(gè)位點(diǎn)的同源序列,其中簡(jiǎn)約性信息位點(diǎn)97個(gè),約占全部位點(diǎn)的17.6﹪.分析了鮡科魚(yú)類16S rRNA基因部分序列莖區(qū)(stem regions)和環(huán)區(qū)(loop

3、regions)的進(jìn)化特點(diǎn);計(jì)算了Kimura 2-Parameter遺傳距離;并用鄰接法、最大簡(jiǎn)約法、最大似然法重建了鮡科魚(yú)類分子系統(tǒng)樹(shù).將S7核糖體蛋白基因內(nèi)含子2首次用作遣傳標(biāo)記進(jìn)行中國(guó)鮡科魚(yú)類的系統(tǒng)發(fā)育分析.通過(guò)PCR技術(shù),擴(kuò)增了長(zhǎng)度為154bp的金氏(魚(yú)央)和擬緣(魚(yú)央)以及長(zhǎng)度為153~168 bp的11種鮡科魚(yú)類(17個(gè)樣品)的rpS7基因內(nèi)含子2序列.序列比對(duì)得到181個(gè)排列位點(diǎn),其中簡(jiǎn)約信息位點(diǎn)56個(gè),占全部位點(diǎn)的30

4、.9﹪.分析了鮡科魚(yú)類S7核糖體蛋白基因內(nèi)含子2序列,計(jì)算了p-distance和Kimura 2-Parameter遺傳距離,并用鄰接法、最大簡(jiǎn)約法、最大似然法重建了鮡科魚(yú)類分子系統(tǒng)樹(shù).由于替代飽和,系統(tǒng)發(fā)育分析時(shí),沒(méi)有選擇外類群.隨后,巨魾(Bagarius yarrelli)用作樹(shù)根分析.石爬鮡屬魚(yú)類的青石爬鮡和黃石爬鮡的物種界限一直不清楚.采用形態(tài)判別和線粒體16SrRNA基因片段分析相結(jié)合的方法,分別研究分析了青石爬鮡和黃石爬