IKCa1相關的miRNA對HeLa細胞增殖、遷移及侵襲作用機制初探.pdf_第1頁
已閱讀1頁,還剩69頁未讀, 繼續(xù)免費閱讀

下載本文檔

版權說明:本文檔由用戶提供并上傳,收益歸屬內(nèi)容提供方,若內(nèi)容存在侵權,請進行舉報或認領

文檔簡介

1、目的:1.探討中電導鈣激活鉀離子通道(IKCal)對HeLa細胞增殖、遷移及侵襲特性的影響;2.探究IKCal對miRNA表達譜的影響,篩選出與IKCal相關的miRNA,并通過生物信息學預測其靶基因,對其靶基因進行功能分析(GO分析),篩選出差異顯著的miRNA,,對其靶基因進行信號通路富集分析,初步探索IKCal相關miRNA與HeLa細胞增殖、侵襲及轉移的相關關系,為進一步探究miRNA在預防和治療宮頸癌的靶標分子中提供了線索。<

2、br>  方法:1.分別設置濃度為0、10.0、20.0、30.0、40.0μmol/L TRAM-34(IKCal特異性阻斷劑)為觀察1-5組及等體積的DMSO組(TRAM-34溶劑)處理HeLa細胞24h、48h和72h,采用CCK8實驗檢測HeLa細胞增殖特性;采用劃痕實驗測量HeLa細胞實際遷移距離從而檢測HeLa細胞遷移特性;2.按上述6組分組處理HeLa細胞48小時后用Transwell實驗檢測其侵襲特性;3.通過本研究前期

3、預實驗、查閱相關文獻、結合CCK8實驗及劃痕實驗結果篩選0.0、30.0μmol/L TRAM-34分別處理HeLa細胞48小時作為對照組和實驗組,采用高通量測序方法檢測IKCal阻斷前、后miRNA表達譜的變化;4.采用qRT-PCR法對部分差異顯著表達miRNAs進行驗證,從而驗證高通量測序結果的準確性;5.運用miRanda、miRWalK、Targetscan、DIANAmT、miRDB等軟件預測篩選的差異顯著表達miRNA可能

4、調控的靶基因以及GO功能分析;再從表達譜中上調和下調的miRNA中各選一個與宮頸癌密切相關的miRNA作為研究對象即為靶miRNA,對其靶基因進行信號通路富集分析。
  結果:1.CCK8實驗提示TRAM-34抑制HeLa細胞的增殖,在一定范圍內(nèi),具有劑量依賴性,在培養(yǎng)細胞24h時DMSO組、觀察1組和觀察2組三組間差異均不具有統(tǒng)計學意義(p>0.05),其余各組與DMSO組及與觀察1組之間具有顯著性差異(p<0.001);而培養(yǎng)

5、HeLa細胞48、72h后,DMSO與觀察1組間差異不具有統(tǒng)計學意義(p>0.05),而其余各觀察組與觀察1組、DMSO組之間差異均具有統(tǒng)計學意義(p<0.001),提示本實驗中MDSO濃度對HeLa細胞無影響;劃痕實驗提示TRAM-34能抑制HeLa細胞遷移,在一定范圍內(nèi),具有時間及劑量依賴性,隨著濃度增加及作用時間延長,抑制遷移作用越明顯(p<0.001))。2.Transwell侵襲實驗證明,在一定濃度范圍內(nèi),HeLa細胞的侵襲率

6、隨TRAM-34濃度增加呈遞減趨勢(F=384.050,p<0.001)。3.分析對照組與實驗組的miRNA高通量測序結果,通過對不同樣本的Clear data的比較,分析其共有序列及特有的序列,以Fold Change≧1.5,qvalue<0.01為差異顯著表達的篩選標準,在871條差異表達中篩選出20個差異顯著表達的miRNAs,其中15個差異miRNA表達上調,5個差異miRNA表達下調。4.結合高通量測序結果及查閱相關文獻,在

7、15個表達上調的miRNA中挑選4個(hsa-miR-451a、hsa-miR-122-5P、hsa-miR-143-3P、hsa-miR-223-3P)和5個表達下調的miRNA中挑選1個(hsa-miR-421)進行qRT-PCR驗證,結果顯示hsa-miR-451a、hsa-miR-122-5P、hsa-miR-143-3、hsa-miR-421表達量的變化趨勢與高通量測序的結果一致,在實驗組與對照組中差異均具有統(tǒng)計學意義(P<0

8、.05),從而檢測高通量測序結果的準確性;5.通過生物信息學分析發(fā)現(xiàn),差異顯著的miRNA的靶基因主要富集蛋白結合,細胞代謝過程、運輸過程等條目;其中hsa-miR-143-5P、hsa-miR-421與多種腫瘤的發(fā)生、發(fā)展密切相關。通過對hsa-miR-143-5P、hsa-miR-421進一步行信號通路分析發(fā)現(xiàn),hsa-miR-143--5P靶基因主要涉及到腫瘤蛋白多糖、p53信號通路、癌癥相關通路及MAPK信號通路等過程,其中在p

溫馨提示

  • 1. 本站所有資源如無特殊說明,都需要本地電腦安裝OFFICE2007和PDF閱讀器。圖紙軟件為CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.壓縮文件請下載最新的WinRAR軟件解壓。
  • 2. 本站的文檔不包含任何第三方提供的附件圖紙等,如果需要附件,請聯(lián)系上傳者。文件的所有權益歸上傳用戶所有。
  • 3. 本站RAR壓縮包中若帶圖紙,網(wǎng)頁內(nèi)容里面會有圖紙預覽,若沒有圖紙預覽就沒有圖紙。
  • 4. 未經(jīng)權益所有人同意不得將文件中的內(nèi)容挪作商業(yè)或盈利用途。
  • 5. 眾賞文庫僅提供信息存儲空間,僅對用戶上傳內(nèi)容的表現(xiàn)方式做保護處理,對用戶上傳分享的文檔內(nèi)容本身不做任何修改或編輯,并不能對任何下載內(nèi)容負責。
  • 6. 下載文件中如有侵權或不適當內(nèi)容,請與我們聯(lián)系,我們立即糾正。
  • 7. 本站不保證下載資源的準確性、安全性和完整性, 同時也不承擔用戶因使用這些下載資源對自己和他人造成任何形式的傷害或損失。

最新文檔

評論

0/150

提交評論