大豆油脂合成基因家族的適應性進化研究.pdf

1、目的：對大豆和擬南芥、苜蓿、百脈根、番茄、葡萄6個雙子葉植物的全基因組進行比較基因組學系統(tǒng)發(fā)育分析，確定油脂合成基因家族，大豆油脂合成基因受環(huán)境的選擇情況，發(fā)生基因丟失和基因置換進行遺傳重組，探索大豆油脂合成基因家族的適應性進化規(guī)律。
　　方法：以大豆、擬南芥、苜蓿、百脈根、番茄、葡萄為研究對象，同源比對搜索確定油脂合成基因家族成員，構建系統(tǒng)發(fā)育樹。利用共線性分析軟件對物種基因內、物種間的同源染色體片段進行推斷，結合同源基因組結構

2、分析，確定多倍化產生的重復基因片段。對油脂合成基因進行正選擇分析、基因置換分析，結合多倍化產生的重復基因的特征，推斷該基因家族適應性進化與多倍化的關系。
　　結果：在大豆、擬南芥、苜蓿、百脈根、番茄、葡萄中篩選4215個油脂合成基因，其中大豆有1259個基因。基因組同源結構分析，發(fā)現(xiàn)大豆自身、大豆和其他5個物種存在大量的DNA重復片段；大豆1259個油脂合成基因中有16.68％的基因參與基因轉換，80.04%的基因處于全基因組加倍