中國文昌魚cDNA文庫的分析及免疫相關基因的研究.pdf

1、中山大學博士學位論文中國文昌魚cDNA文庫的分析及免疫相關基因的研究姓名：董美玲申請學位級別：博士專業(yè)：生物化學與分子生物學指導教師：徐安龍20050608中山大學博士學位論文：中國文昌魚cDNA文庫的分析及免疫相關基因的研究種文昌魚之間的差異。初步的分析顯示，只有294％的ESTclusters是兩者共有的，其中9508條ESTs來自我們的數(shù)據(jù)庫而5547條ESTs來自佛羅里達文昌魚。我們重點對這些序列中的免疫相關的基因進行了分析，通

2、過生物信息學的分析，我們得到與免疫相關的291條consensus序列，其中183條ESTs是singleton754條ESTs拼接成108條clusters，并將它們按照BLAST比對上的基因功能分成10類。分析這些免疫相關基因在不同文庫中的分粕情況，可以發(fā)現(xiàn)消化道，神經胚和卵巢文庫是這些免疫相關基因的主要來源(占了總數(shù)的80，1％)。在這些數(shù)據(jù)里面我們發(fā)現(xiàn)了兩個與重排基因酶(RAGs)相關的基因(RGA、RCHl)，另外還發(fā)現(xiàn)了兩個

3、免疫球蛋白超家族成員上VCBP和VCP，其中VCP(望一andCdomainbearingprotein)是一個新的免疫球蛋白超家族成員。另外在我們的數(shù)據(jù)中，發(fā)現(xiàn)許多與NtC抗原呈遞相關分子有同源性的序列，例如與抗原分解和轉運有關的酶和轉運分子，還有分子伴侶等等，而在高等脊椎動物中這些分子中的一部分恰好位于MHc區(qū)域內。我們也發(fā)現(xiàn)部分和參與先天性和適應性免疫中信號轉導桶關的分子有同源性的序列，包括了一些膜受體分子——典型的cD類分子(C

4、D9，CD20，CD53，CD63，CD8】and@82)和％umor_necrosisfactor(TNF)receptor，細胞因子(pre—B—cellcolony—enhancingfactor)，激酶分子(MAPK通路里面的一些成員)，轉錄因子(earlyBcellfactor，ETSandlymphoidtranscriptionfactor)。其中我們對上述十大類免疫相關基因中的七個免疫相關基因(RGA、RCHI、GILT