基于異構網(wǎng)絡模型的致病基因預測算法.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、隨著人類基因組計劃的順利完成，遺傳疾病致病基因的預測成為生物信息學中一個重要的研究課題。致病基因的預測對于生物實驗的實施，改善醫(yī)療護理延長病人存活周期和藥物靶標的發(fā)現(xiàn)等方面具有重大的指導意義。隨著生物信息學的發(fā)展，多種類型的人類生物網(wǎng)絡在疾病基因預測問題上發(fā)揮越來越大的作用。相似的疾病是由功能相關的基因導致的，基于這個普遍接受的假設，目前出現(xiàn)了大量方法基于蛋白質相互作用網(wǎng)絡對致病基因進行排序實現(xiàn)致病基因的預測。有效地利用不同網(wǎng)絡間所隱含

2、的生物意義對基因預測問題會有更大的幫助。
　　本文首先從OMIM數(shù)據(jù)庫提取疾病-基因對應關系建立一個二分圖網(wǎng)絡，該網(wǎng)絡連接疾病相似性網(wǎng)絡和蛋白質相互作用網(wǎng)絡，形成新的異構網(wǎng)絡。然后針對致病基因預測問題的特點改進傳統(tǒng)的隨機游走算法，應用在該異構網(wǎng)絡上。不但利用網(wǎng)絡內(nèi)的拓撲結構，也考慮到了兩個網(wǎng)絡間的對應關系，來有效預測疾病和基因之間潛在的對應關系。實驗結果生成疾病候選致病基因的排序，用該方法不但可以對致病基因已知的疾病進行候選致病基

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