邊雞MSTN基因、MyoD家族部分基因和Smad3基因多態(tài)性與生長(zhǎng)和屠體性狀的相關(guān)性分析以及表達(dá)的研究.pdf_第1頁(yè)
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文檔簡(jiǎn)介

1、本研究檢測(cè)了七世代邊雞群體以及MSTN、MyoD家族部分基因(包括MyoD、MyoG和Myf5基因)和Smad3基因的多態(tài)性,并與七世代邊雞的生長(zhǎng)性狀進(jìn)行相關(guān)性分析;同時(shí)利用本課題組前期發(fā)現(xiàn)的MSTN基因G2283A位點(diǎn)效應(yīng)建立的八世代快慢型群體中對(duì)MSTN基因、MyoD家族部分基因以及Smad3基因進(jìn)行多位點(diǎn)和多基因的聚合分析,探討不同基因型組合之間的合并基因型對(duì)生長(zhǎng)和屠體性狀的效應(yīng)大小。采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR法研究5個(gè)基因在邊雞胸肌

2、和腿肌中的表達(dá)關(guān)系。主要研究結(jié)果如下:
  1.利用PCR-RFLP技術(shù)發(fā)現(xiàn)MSTN基因G2283A位點(diǎn)在七世代邊雞中表現(xiàn)為中度多態(tài),相關(guān)分析表明,該位點(diǎn)對(duì)七世代和八世代邊雞的生長(zhǎng)和屠體性狀以及肌纖維特性具有顯著或極顯著的影響(P<0.05或P<0.01)。
  2.以雞MyoD基因?yàn)楹蜻x基因,在邊雞群體內(nèi)檢測(cè)到4個(gè)SNPs,其中外顯子中1處T576C的突變,沒(méi)有引起氨基酸的變化,為同義突變。內(nèi)含子中3處,分別為G605A、

3、C1837T和G1846A。七世代和八世代群體中,MD-3和MD-4位點(diǎn)均為低度多態(tài),且偏離了哈代溫伯格平衡(P<0.05)。相關(guān)性分析表明,MyoD基因MD-3和MD-4位點(diǎn)對(duì)七世代邊雞生長(zhǎng)性狀有顯著或極顯著影響(P<0.05或P<0.01)。MD-3和MD-4位點(diǎn)不同基因型組合中AA/DD和AA/CC為優(yōu)勢(shì)基因型。八世代快慢型群體內(nèi),MD-3對(duì)生長(zhǎng)和屠體性狀有顯著或極顯著的影響(P<0.05或P<0.01); MD-4位點(diǎn)對(duì)生長(zhǎng)性狀

4、有顯著或極顯著的影響(P<0.05或P<0.01)??炻腿后w間,MyoD基因MD-3和MD-4位點(diǎn)與MSTN基因G2283A位點(diǎn)的基因型組合對(duì)生長(zhǎng)和屠體性狀的效應(yīng)要大于單個(gè)MD-3和MD-4位點(diǎn)的效應(yīng),主要表現(xiàn)為品系效應(yīng)。
  3.以雞MyoG基因?yàn)楹蜻x基因,在邊雞群體內(nèi)檢測(cè)到2個(gè)SNPs,分別為第3外顯子T2827C突變和G2957A突變,兩處突變均沒(méi)有引起氨基酸的變化,為同義突變。七世代和八世代群體中,MG-5位點(diǎn)均為高度多

5、態(tài),且處于了哈代溫伯格平衡(P>0.05)。相關(guān)性分析表明,MyoG基因MG-5位點(diǎn)對(duì)七世代邊雞6-10周齡體重有顯著影響(P<0.05)。八世代快慢型群體內(nèi),MG-5位點(diǎn)對(duì)生長(zhǎng)和屠體性狀沒(méi)有顯著影響(P>0.05)??炻腿后w間,MyoG基因MG-5位點(diǎn)與MSTN基因G2283A位點(diǎn)的基因型組合對(duì)生長(zhǎng)和屠體性狀有顯著或極顯著的影響(P<0.05或P<0.01),主要還是表現(xiàn)為品系效應(yīng)。
  4.以雞Myf5基因?yàn)楹蜻x基因,在邊雞

6、群體內(nèi)檢測(cè)到3個(gè)SNPs,分別為第1外顯子中的C238T、G264A和A532G突變,均沒(méi)有引起氨基酸的變化,為同義突變。七世代和八世代群體中,MY5-1位點(diǎn)分別為高度和中度多態(tài),MY5-3位點(diǎn)均為中度多態(tài),且兩位點(diǎn)均處于哈代溫伯格平衡(P<0.05)。相關(guān)性分析表明,Myf5基因MY5-1和MY5-3位點(diǎn)對(duì)七世代邊雞生長(zhǎng)性狀有顯著或極顯著影響(P<0.05或P<0.01)。不同基因型組合中HH/NN和HJ/NN為優(yōu)勢(shì)基因型。八世代快慢

7、型群體內(nèi),MY5-1和MY5-3位點(diǎn)對(duì)生長(zhǎng)和屠體性狀有顯著或極顯著的影響(P<0.05或P<0.01); MY5-3位點(diǎn)對(duì)生長(zhǎng)性狀有顯著或極顯著的影響(P<0.05或P<0.01)。快慢型群體間,Myf5基因MY5-1和MY5-3位點(diǎn)與MSTN基因G2283A位點(diǎn)的基因型組合對(duì)生長(zhǎng)和屠體性狀的效應(yīng)要大于Myf5基因單個(gè)多態(tài)位點(diǎn)的效應(yīng)。
  5.以雞Smad3基因?yàn)楹蜻x基因,在邊雞群體內(nèi)檢測(cè)到1個(gè)SNPs,位于第8外顯子A57099

8、T的突變,該位點(diǎn)沒(méi)有引起氨基酸的變化,為同義突變。七世代和八世代群體中,S8位點(diǎn)均為中度多態(tài),均處于了哈代溫伯格平衡(P>0.05)。相關(guān)性分析表明,Smad3基因S8位點(diǎn)對(duì)七世代邊雞生長(zhǎng)性狀沒(méi)有顯著影響(P>0.05)。八世代快慢型群體內(nèi),S8位點(diǎn)對(duì)屠體性狀有顯著或極顯著影響(P<0.05或P<0.01)。快慢型群體間,Smad3基因S8位點(diǎn)與MSTN基因G2283A位點(diǎn)的基因型組合對(duì)生長(zhǎng)和屠體性狀有顯著或極顯著的影響(P<0.05或

9、P<0.01)。
  6.MSTN基因、MyoD家族部分基因和Smad3基因的表達(dá)調(diào)控分析結(jié)果表明:MSTN基因在野生型(MM)個(gè)體的胸肌和腿肌中的表達(dá)量顯著和極顯著高于其在突變型(KK)個(gè)體相同肌肉組織中的的表達(dá)量(P<0.05和P<0.01)。MyoD基因在腿肌中的表達(dá)量與MSTN基因的表達(dá)量呈正相關(guān);MyoD基因在胸肌中的表達(dá)量與MSTN基因的表達(dá)量呈負(fù)相關(guān)。MyoD基因MD-3位點(diǎn)和MSTN基因G2283A位點(diǎn)不同基因型組

10、合對(duì)MyoD基因表達(dá)量有顯著影響(P<0.05)。MyoD基因MD-4位點(diǎn)和MSTN基因G2283A位點(diǎn)不同基因型組合個(gè)體胸肌和腿肌中的MyoD基因表達(dá)量差異均不顯著(P>0.05)。MyoG基因的表達(dá)量與MSTN基因的表達(dá)量呈負(fù)相關(guān)。MyoG基因MG-5位點(diǎn)和MSTN基因G2283A位點(diǎn)不同基因型組合對(duì)MyoG基因表達(dá)量有顯著或極顯著影響(P<0.05或P<0.01)。Myf5基因的表達(dá)量與MSTN基因的表達(dá)量呈負(fù)相關(guān)。Myf5基因M

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