口腔扁平苔蘚患者血清的蛋白質(zhì)組學(xué)研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、口腔扁平苔蘚(oral lichen planus,OLP)是一種可長期反復(fù)發(fā)作的慢性口腔黏膜病,因長期糜爛病損易癌變,WHO將其列入癌前狀態(tài)。OLP的發(fā)生發(fā)展與心理因素、內(nèi)分泌因素、免疫因素、感染因素等有關(guān),但具體發(fā)病機制尚不明確。因?qū)ζ浒l(fā)病機制研究不明,治療一直沒有顯著的效果。因此對于口腔扁平苔蘚發(fā)病機制的探尋成為目前急需解決的問題。近些年來,生命科學(xué)出現(xiàn)了一個嶄新的時代——蛋白質(zhì)組時代,蛋白質(zhì)組學(xué)是繼基因組研究基礎(chǔ)上發(fā)展起來的一門

2、科學(xué),是通過對基因轉(zhuǎn)錄、合成后的產(chǎn)物蛋白質(zhì)動態(tài)和整體水平上的研究,可以直接闡明生命在生理和病理條件下可能的發(fā)病機制。蛋白質(zhì)組技術(shù)發(fā)展迅速,雙向凝膠電泳是最主要的分離方法,雙向熒光差異凝膠電泳(two-dimensional fluorescencedifference in gel electrophoresis,2-D DIGE)技術(shù)是在傳統(tǒng)的雙向凝膠電泳的基礎(chǔ)上將對照組和實驗組樣品分別用熒光染料標(biāo)記,然后混和在一起再進行雙向凝膠電泳

3、,根據(jù)不同熒光材料激發(fā)不同的波長,使差異蛋白點以不同的顏色表現(xiàn)在2D膠的圖像上,從而檢測到蛋白樣品間微小表達差異,有更高的靈敏性、重復(fù)性、準(zhǔn)確性?,F(xiàn)在此技術(shù)已經(jīng)廣泛應(yīng)用于國內(nèi)外醫(yī)學(xué)研究,尤其是應(yīng)用此技術(shù)鑒定出與癌癥相關(guān)的分子標(biāo)記物,從而為抑制細(xì)胞惡性分化,為開發(fā)治療藥物奠定理論基礎(chǔ)。但是目前國內(nèi)外研究對于運用2-D DIGE技術(shù)研究口腔扁平苔蘚的報道十分罕見,因此本研究采用此技術(shù)篩選并且鑒定口腔扁平苔蘚患者和健康人血清中的差異蛋白,進一

4、步探討其可能的作用機制。
  目的:應(yīng)用2-D DIGE以及液相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)篩選、鑒定口腔扁平苔蘚患者及健康人血清差異蛋白,進而分析口腔扁平苔蘚患者與健康人相關(guān)蛋白水平有哪些變化,差異蛋白的功能及可能與口腔扁平苔蘚有哪些關(guān)系,使口腔扁平苔蘚的早期診斷預(yù)防、生物蛋白靶向治療、預(yù)后判斷趨于可能,同時也可證實雙向熒光差異凝膠電泳在口腔扁平苔蘚研究中具有實用價值。
  方法:
  1兩種提取人血清蛋白方法比較:采用甲醇、

5、10mM碳酸氫銨沉淀蛋白法和苯酚抽提的方法分別提取健康志愿者的血清蛋白,Bradford法測蛋白含量,進行十二烷基硫酸鈉-聚丙烯酰胺凝膠電泳,考馬斯亮藍(lán)染色,脫色后對比兩種方法得到的蛋白條帶,選擇適合人血清蛋白的提取方法。
  2雙向熒光差異凝膠電泳:隨機選出6例口腔扁平苔蘚初診患者和6例健康志愿者并抽取靜脈血,分離血清,提取血清蛋白,Bradford法測定蛋白含量,十二烷基硫酸鈉-聚丙烯酰胺凝膠電泳檢測各樣品蛋白重復(fù)性、蛋白降解

6、情況。雙向熒光差異凝膠電泳分離蛋白,Typhoon9410掃描儀對2-D DIGE膠進行掃描,然后Deep Purple染色,DeCyderTM差異分析軟件6.5版搜索差異點,將差異表達量大于1.2倍的蛋白質(zhì)點進行標(biāo)記并生成挖點坐標(biāo)文件,導(dǎo)出后用Ettan spot picker挖點。
  3液相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)鑒定差異蛋白:挖出蛋白膠粒清洗、Trypsin溶液酶解成多肽,LTQ XL增強型二維線性離子阱質(zhì)譜儀鑒定,應(yīng)用Biow

7、orks Browser3.3.1軟件通過ESQUEST運算方法在蛋白數(shù)據(jù)庫(NCBI中的human fasta數(shù)據(jù)2013.12.10)搜索差異蛋白的酶解肽段,以確定被測差異蛋白可能的名稱,從而鑒定可能的蛋白質(zhì)。
  結(jié)果:
  1選擇人血清蛋白提取的最適合方法:本研究采用了甲醇、10mM碳酸氫銨沉淀蛋白法和苯酚抽提的方法分別提取血清蛋白,Bradford法測蛋白含量,進行十二烷基硫酸鈉-聚丙烯酰胺凝膠電泳,比較發(fā)現(xiàn)用苯酚

8、抽提方法得到的電泳條帶更清晰,蛋白純化程度更高,因此選擇苯酚抽提的方法用于本研究。
  2十二烷基硫酸鈉-聚丙烯酰胺凝膠電泳顯示:檢測各樣品蛋白顯示各樣品蛋白條帶清晰,蛋白重復(fù)性較好,無明顯蛋白丟失現(xiàn)象。
  3雙向熒光凝膠電泳結(jié)果
  口腔扁平苔蘚患者血清與健康人血清因用不同顏色的熒光染料標(biāo)記,在2-D DIGE分離時,一些蛋白點是兩種顏色的重合,即呈現(xiàn)出黃色,說明在口腔扁平苔蘚患者血清和健康人中均有相同程度的表達,

9、而另外還有一些各自特異高表達的蛋白點通過各自熒光染色的顏色顯現(xiàn)出來,即呈現(xiàn)出紅色或者綠色。經(jīng)6個生物學(xué)重復(fù),從而測得差異蛋白點平均為(583±183)個,選出重復(fù)性較好的差異點20個鑒定,得到12種蛋白,其中7種蛋白在患者血清中表達量降低,5種蛋白表達量升高。
  4液相色譜-質(zhì)譜鑒定差異蛋白:鑒定出12種差異蛋白,分別是結(jié)合珠蛋白、銅藍(lán)蛋白、血清補體C3、載脂蛋白A-Ⅰ、激肽原、維生素D、α-2-巨球蛋白、人抗凝血酶Ⅲ、分泌型I

10、gA、血清補體成分C9、人類因子B、β-1-金屬結(jié)合球蛋白。
  結(jié)論:
  1苯酚抽提的方法更適合人血清蛋白的提取。
  2口腔扁平苔蘚患者血清中存在差異蛋白,差異蛋白點平均為(583±183)個,重復(fù)性較好的差異蛋白12個并且表達量發(fā)生變化,其中7個在患者血清中表達量降低,5個表達量升高。
  3口腔扁平苔蘚患者血清中質(zhì)譜鑒定到得蛋白12個,其中結(jié)合珠蛋白、銅藍(lán)蛋白、血清補體C3、載脂蛋白A-Ⅰ、激肽原、維生

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