結核分枝桿菌中小RNA的生物信息學預測.pdf

1、結核病嚴重威脅著人類的生命與健康。根據(jù)世界衛(wèi)生組織的統(tǒng)計，2008年全球估計有130萬人死于結核病，新增結核病患者940萬人，結核病疫情嚴重。在上個世紀60到70年代結核病曾經一度被有效控制。但是隨著多重耐藥菌株和廣泛耐藥菌株的出現(xiàn)，結核病在全球范圍內卷土重來，嚴重威脅人類的健康，新藥的研發(fā)與問世迫在眉睫。因此，發(fā)現(xiàn)新的抗結核病藥物靶標，為新型抗結核病藥物的研發(fā)提供指導，成為治療結核病研究中的首要任務。
　　 Small RNA

2、(sRNA)是的細菌中的調節(jié)因子，其重要的調節(jié)功能在近十年被逐漸報道。它們由基因組編碼，但是絕大多數(shù)不編碼蛋白產物。通過與mRNA分子互補配對作用或者影響蛋白分子的活性，sRNA在細胞對環(huán)境脅迫的應答過程中發(fā)揮作用。sRNA受到全局調節(jié)子的調控，參與許多重要的細菌生理途徑，也是許多通路中的重要節(jié)點，因而sRNA成為揭示這些通路全貌的新的研究切入點。
　　 目前對分枝桿菌中的sRNA的研究剛剛起步。本文通過生物信息學的方法對結核分

3、枝桿菌中的sRNA進行預測，希望能夠發(fā)現(xiàn)新的sRNA分子，為揭示結核分枝桿菌復雜的胞內生存機制與持留性感染相關的重要生理途徑提供新的研究的切入點，為新藥靶點的開發(fā)提供幫助。
　　 本文嘗試了兩種方法來對結核分枝桿菌H37Rv菌株中的sRNA進行預測。這兩種方法分別是通過尋找在近緣菌種間保守的基因間序列進行預測和通過尋找基因組中可能的轉錄信號進行預測。然后對預測結果進行BLAST分析，評價其可信度并篩選掉部分可能的蛋白編碼序列。通