野生香菇數(shù)量性狀 與SSR分子標記的關聯(lián)分析.pdf

1、香菇(Lentinula edodes)目前已是世界上產(chǎn)量僅次于雙孢蘑菇的人工栽培食用菌，是東亞地區(qū)最重要的食用菌之一。中國幅員遼闊，有著相當豐富的香菇自然種質(zhì)資源，這些自然種質(zhì)資源為香菇的遺傳育種提供了優(yōu)良材料。香菇大多數(shù)農(nóng)藝性狀和經(jīng)濟性狀表現(xiàn)為連續(xù)變異的數(shù)量性狀，受多基因控制，易受環(huán)境影響，采用常規(guī)育種方法很難對這些性狀進行改良。分子標記技術的發(fā)展為分子標記輔助育種提供了可能性。香菇QTL定位工作尚處于起步階段，存在亟待改進之處。以

2、連鎖不平衡為基礎的關聯(lián)分析方法為香菇數(shù)量性狀的遺傳研究提供了新的方法，也為香菇分子標記輔助育種研究提供了新的思路。
　　 本研究以采集于全國14個省份的香菇93個野生菌株和1個栽培菌株為研究材料，利用篩選出的34對SSR分子標記，對群體進行全基因組分子掃描，分析我國野生香菇的遺傳多樣性及群體結構，利用基于連鎖不平衡的關聯(lián)分析方法，對香菇13個數(shù)量性狀與34個SSR分子標記的關聯(lián)性進行了研究。主要結果如下:
　　 1.利用

3、34對SSR標記對94個香菇菌株進行遺傳多樣性、主成分分析(PCA)和群體結構分析。結果表明，34對引物共擴增出169條帶，其中多態(tài)性條帶為162條，多態(tài)性為95.9％。期望雜合度（He）、多態(tài)性信息含量(PIC)和Shannon信息指數(shù)平均值分別為0.44、0.4和0.89，表明我國香菇野生菌株存在較高的遺傳多樣性，可以作為關聯(lián)分析的材料。利用UPGMA聚類分析、主成分分析(PCA)和群體結構分析均可將94個菌株劃分為3個主要類群，三

4、者結果之間具有較高一致性。
　　 2.對34對SSR標記位點形成的561個成對組合位點進行連鎖不平衡分析，共有150個位點組合存在一點程度的連鎖不平衡，占總位點組合數(shù)的26.74％，連鎖不平衡度都較低，大部分集中在0-0.2之間。基于r2統(tǒng)計概率P＜0.01支持的不平衡組合位點數(shù)為67，占不平衡成對組合位點數(shù)的44.67％，占總位點組合數(shù)的11.94％，r2＞0.2的組合位點數(shù)僅有3對，占總組合位點數(shù)的0.53％。
　　

5、 3.利用TASEEL2.0軟件中的一般線性模型對34個SSR標記位點與13個性狀進行關聯(lián)分析，共檢測出6個與4個性狀顯著關聯(lián)的位點。其中與木屑培養(yǎng)基生長速度顯著關聯(lián)的位點有3個，分別為IS017、LEP2和X015，其變異解釋率分別為26.49％、16.59％和33.91％，總解釋率達到76.99％。位點LEN41與菌蓋直徑顯著關聯(lián)，變異解釋率為17.04％。位點LTY1與菌蓋厚度顯著關聯(lián)，變異解釋率為31.65％;位點F041與原基

6、期顯著相關聯(lián)，變異解釋率為9.9％。
　　 4.進一步分析與性狀顯著關聯(lián)位點的優(yōu)異等位變異，發(fā)掘出對農(nóng)藝性狀具有優(yōu)異等位變異的典型載體材料。結果表明，在與木屑培養(yǎng)基生長速度顯著關聯(lián)位點的等位變異中，X015-1增效表型效應最大;在與菌蓋直徑顯著關聯(lián)的等位變異中，LEN41-1增效表型效應最大;在與菌蓋厚度顯著關聯(lián)的等位變異中，LTY1-2增效表型效應最大;在與原基期顯著關聯(lián)的等位變異中，F(xiàn)041-1減效表型效應最大。本試驗研究結