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文檔簡介
1、α-半乳糖苷酶(α-galactosidase,EC3.2.1.22)是廣泛存在于高等植物、動物和微生物中的一類重要水解酶。本實驗室根據(jù)其他物種中α-半乳糖苷酶序列的保守區(qū)段,已經(jīng)克隆了4種黃瓜α-半乳糖苷酶的全長cDNA序列。通過已公布的黃瓜基因組序列,根據(jù)同源性分析,發(fā)現(xiàn)黃瓜基因組中還存在另兩種α-半乳糖苷酶基因。
本論文利用反轉(zhuǎn)錄PCR(reversetranscription-PCR,RT-PCR)和cDNA末端快
2、速擴增(RapidamplificationofcDNAends,RACE)技術(shù)克隆了這兩種酶的cDNA全長,分別命名為:黃瓜酸性α-半乳糖苷酶Ⅲ和黃瓜堿性α-半乳糖苷酶Ⅲ,GenBank登錄號分別為JN680267和JQ327828,序列結(jié)果表明:黃瓜酸性α-半乳糖苷酶Ⅲ基因編碼430個氨基酸,編碼的蛋白質(zhì)理論分子量為47.9KD。黃瓜堿性α-半乳糖苷酶Ⅲ基因編碼783個氨基酸,編碼的蛋白質(zhì)理論分子量為86.1KD。對根據(jù)cDNA序列
3、推斷出的蛋白質(zhì)序列分析結(jié)果表明,酸性α-半乳糖苷酶Ⅲ蛋白C端存在一段信號肽,將定位于液胞中,而堿性α-半乳糖苷酶Ⅲ則分布于細胞質(zhì)中。
收集目前GenBank中已發(fā)布的高等植物的α-半乳糖苷酶序列,聚類分析結(jié)果表明,酸性α-半乳糖苷酶可分為3組,黃瓜的3種酸性α-半乳糖苷酶分屬其中的1組;堿性α-半乳糖苷酶分為3組,其中每組均包含黃瓜的1種堿性α-半乳糖苷酶。結(jié)合相關(guān)報道,對這6組酶的生物學(xué)功能進行了總結(jié)分析,結(jié)果表明:酸性
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