蘋果MdGLRs家族基因的生物信息學鑒定及表達分析.pdf

1、本文運用生物信息學分析技術對蘋果中的MdGLRs基因及編碼蛋白進行了初步研究，并簡要分析了基因在冷害逆境下的表達情況。這些MdGLRs基因是根據蘋果基因組數據庫預測的獲得，對于這些基因的具體的生理作用及如何參與體內代謝是需要研究的內容。本文的初步研究為克隆蘋果MdGLRs及鑒定其生物學功能奠定了重要基礎。主要研究結果如下：
　　 1.從蘋果基因組數據庫中搜索出32個與AtGLRs對應的、具有一定序列同源性的蘋果核酸和蛋白序列組成

2、蘋果MdGLRs家族。將所有MdGLRs分成Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ三個亞家族，并進行了編號。
　　 2.22個MdGLRs包含有全部與擬南芥同源的6個保守結構域(S1-M1-M2-M3-S2-M4)；MdGLR3.9、MdGLR3.11、MdGLR3.13和AtGLR2.6缺失M2保守域，MdGLR2.2、MdGLR3.5、MdGLR3.13與AtGLR2.4、AtGLR2.6相似，含有結構不完整的M3保守域，MdGLR3.14則沒有M4結

3、構域。
　　 3.用SMART預測得出MdGLRs均為膜蛋白，內部含有一個PBPs結構域，PBPs具有外源谷氨酸門控離子通道活性，能綁定外源谷氨酸到離子通道復合體，使通道開放，催化離子的跨膜轉運。TMHMM Serverv.2.0分析MdGLRs的跨膜結構位置多位于500到800個氨基酸之間，該區(qū)域也是保守結構域比較集中的區(qū)域。SOPMA程序預測MdGLRs蛋白二級結構主要以由α-螺旋、無規(guī)則卷曲和折疊延伸鏈為主。PSORT預測

4、多數MdGLRs蛋白成員均主要在內質網和質膜上定位。
　　 4.同一亞家族的基因中，各個成員基因在根、莖、葉中的表達情況有差異。
　　 5.MdGLR1.4在根、莖、葉、果皮、果肉中均有表達，在葉中表達量最高。在幼葉、成熟葉、老葉中的表達量為成熟葉>幼葉>老葉。
　　 6.低溫誘導MdGLR1.4在根、莖、葉中的表達，低溫+LaCl3處理使莖和葉中MdGLR1.4的表達量降低，同時ABA處理后的MdGLR1.4的