蟠桃、黃肉桃種質(zhì)資源遺傳多樣性的SSR分析.pdf

1、桃[Prunuspersica（L.）Batsch]系薔薇科李屬植物，我國(guó)是世界桃的起源中心，經(jīng)過(guò)長(zhǎng)期的品種演化、栽培和定向選育過(guò)程，積累了極其豐富的種質(zhì)資源，這些資源對(duì)于優(yōu)質(zhì)新品種的選育和種質(zhì)創(chuàng)新具有重要的意義，更為我國(guó)桃產(chǎn)業(yè)發(fā)展提供了堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ)。桃種質(zhì)資源的遺傳評(píng)價(jià)已經(jīng)從形態(tài)學(xué)、細(xì)胞學(xué)、孢粉學(xué)、同功酶、RAPD標(biāo)記等方面展開(kāi)，獲得了一些桃種群發(fā)生和系統(tǒng)演化的結(jié)論，SSR標(biāo)記作為一種穩(wěn)定的共顯性標(biāo)記具有很高的多態(tài)性，在歐美桃的遺傳評(píng)價(jià)

2、中已經(jīng)廣泛應(yīng)用。本研究采用SSR標(biāo)記技術(shù)對(duì)國(guó)家果樹(shù)種質(zhì)南京桃圃中收集、保存的38份蟠桃種質(zhì)和123份黃肉桃種質(zhì)進(jìn)行了遺傳多樣性鑒定和親緣關(guān)系分析，以期為蟠桃和黃肉種質(zhì)的利用和系統(tǒng)演化提供分子依據(jù)。
　　 1、蟠桃遺傳多樣性和親緣關(guān)系的SSR鑒定結(jié)果：
　　 利用24對(duì)位于桃參考圖譜上8個(gè)連鎖群的SSR引物，對(duì)38個(gè)蟠桃品種和9個(gè)具有典型生態(tài)類(lèi)的桃品種進(jìn)行了鑒定分析。
　　 SSR擴(kuò)增結(jié)果表明，24對(duì)SSR引物共獲

3、得179個(gè)擴(kuò)增位點(diǎn)，其中多態(tài)性位點(diǎn)171個(gè)，多態(tài)率達(dá)95.53％。利用篩選出的位于8個(gè)連鎖群的14對(duì)SSR引物，能將所有試材一一區(qū)分，根據(jù)多態(tài)性條帶在品種中的分布，構(gòu)建了蟠桃分子指紋檢索表；38份蟠桃資源中的12份在指紋圖譜上出現(xiàn)特異條帶，分別是白蜜蟠桃、五月鮮扁干、碧霞蟠桃、美國(guó)蟠桃、玉露蟠桃、陳圃蟠桃、離核蟠桃、124蟠桃、香金蟠、農(nóng)神、瑞蟠3號(hào)、黃露蟠桃，這些資源可作為特異蟠桃資源重點(diǎn)保存。
　　 PopGene32軟件進(jìn)

4、行的遺傳多樣性發(fā)現(xiàn)，蟠桃資源平均Nei’s基因多樣性指數(shù)（He）為0.2425，平均Shannon信息指數(shù)（Ⅰ）為0.3798；南方蟠桃品種群多態(tài)性位點(diǎn)百分率為74.30％，Nei's遺傳多樣性指數(shù)為0.2038，Shannon信息指數(shù)為0.3163；北方蟠桃品種群的遺傳多樣性相對(duì)較高，多態(tài)性位點(diǎn)百分率為91.06％，Nei’s遺傳多樣性為0.2449，Shannon信息指數(shù)為0.3824。群體間存在較小的基因分化系數(shù)（Gst=0.06

5、59），遺傳變異有很大一部分是來(lái)自群體內(nèi)，可能與其較大的基因流Nm=7.0861有關(guān)。
　　 利用NTSYS軟件進(jìn)行的蟠桃UPGMA聚類(lèi)分析結(jié)果表明，在相似系數(shù)為0.67時(shí)，所有南方品種聚于同一類(lèi)群，但北方品種群中新疆蟠桃、黃肉蟠桃及香金蟠也出現(xiàn)在南方品種群中；其他所有北方品種群的蟠桃品種也聚于同一類(lèi)群。該聚類(lèi)結(jié)果從SSR水平上驗(yàn)證了蟠桃多起源假說(shuō)。
　　 2、黃肉桃種質(zhì)資源的遺傳多樣性與親緣關(guān)系的SSR鑒定結(jié)果：

6、>　　 利用28對(duì)SSR引物（其中的26為已定位于桃參考圖譜上8個(gè)不同的連鎖群上）對(duì)123個(gè)黃肉桃品種和20個(gè)其它類(lèi)型桃品種為試材，進(jìn)行了國(guó)內(nèi)外的黃肉桃種質(zhì)資源遺傳多樣性研究。
　　 SSR擴(kuò)增結(jié)果表明，28對(duì)SSR引物共擴(kuò)增出206個(gè)位點(diǎn)，多態(tài)性位點(diǎn)159個(gè)，多態(tài)率為76.56％。具有特異位點(diǎn)的黃肉桃品種為黃離胡、火煉金丹、中熟黃離核、橙香、錦繡、佛爾蒂尼莫蒂尼、大金旦、龍1-2-4、矮油桃1號(hào)、艾維茨、蓓貝勒、哈根、春金、

7、卡路納，這些品種應(yīng)作為黃肉桃種質(zhì)資源重點(diǎn)加以保護(hù)。
　　 通過(guò)PopGen32軟件分析發(fā)現(xiàn)，黃肉桃資源平均Nei's基因多樣性指數(shù)（He）為0.1453，平均Shannon信息指數(shù)（Ⅰ）為0.2299。黃肉桃群體間的遺傳多樣性比較發(fā)現(xiàn)，遺傳多樣性最高的為中國(guó)地方黃肉桃品種群，其次為美洲桃育成黃肉品種群、亞洲育成品黃肉桃種群和歐洲育成黃肉桃品種群。黃肉桃群體間存在較大的基因分化系數(shù)（Gst=0.1329），遺傳變異有很大一部分是來(lái)

8、自群體間，可能與其較小的基因流Nm=3.2613有關(guān)。
　　 利用NTSYS軟件進(jìn)行的蟠桃UPGMA聚類(lèi)分析結(jié)果表明，SSR標(biāo)記的聚類(lèi)結(jié)果基本與地理起源和系譜關(guān)系相吻合，美國(guó)、歐洲和亞洲的育成黃肉桃品種聚為一類(lèi)（Ⅰ類(lèi)）；云南、華北、西北地區(qū)的地方黃肉桃品種聚為一類(lèi)（Ⅱ類(lèi)）；桃亞屬的野生種或近緣種聚于黃桃品種的外側(cè)（Ⅲ類(lèi)）。因?yàn)橄嗷ダ梅N質(zhì)作為親本的緣故，育成品種類(lèi)群（Ⅰ類(lèi)）聚為6個(gè)亞類(lèi)，且歐洲、美國(guó)、亞洲三地的育成品種間明顯存在

9、交叉，中國(guó)和日本育成黃肉桃品種位于Ⅰ-2亞類(lèi)中；歐洲育成黃肉桃品種位于Ⅰ-2、Ⅰ-3亞類(lèi)中；美國(guó)育成品種則分布于所有6個(gè)亞類(lèi)中。中國(guó)地方品種類(lèi)群（Ⅱ類(lèi)）中，大部分來(lái)自新疆的黃肉桃品種聚于大群體（Ⅱ-1）之外，形成Ⅱ-2群體，并且與北方蜜桃和桃亞屬野生種的親緣關(guān)系較近，可能是因?yàn)樾陆S肉桃比較特殊或原始的緣故。
　　 群體間的聚類(lèi)結(jié)果表明，我國(guó)地方黃肉桃品種群體與育成品種群體間親緣關(guān)系較遠(yuǎn)；美國(guó)、亞洲和歐洲育成品種群體間相對(duì)親緣關(guān)