甘藍型油菜——諸葛菜附加系的基因表達研究.pdf

1、十字花科的諸葛菜(Orychophragmus violaceus(L.) O.E.Schulz，2n=24，OO)耐寒性耐陰性強、適生范圍廣、開紫花、種子含油量高、亞油酸比例較高，是一種很好的油料種質(zhì)資源。本研究利用甘藍型油菜（Brassica napusL.，2n=38，AACC）和諸葛菜的體細胞雜種(2n=62，AACCOO)與甘藍型油菜連續(xù)多代回交獲得的四個附加系（附加一條或一對諸葛菜染色體），分別表現(xiàn)諸葛菜花葉性狀（編號1）、

2、雌不育(S)、諸葛菜染色體上的rRNA基因?qū)τ筒说臑轱@性且花瓣基部有淡紫色(4)、諸葛菜染色體上的rRNA基因?qū)τ筒说臑椴糠诛@性(6)。通過這四個附加系的轉(zhuǎn)錄組測序(RNA-seq)，開展如下研究:(1)諸葛菜染色體附加后對油菜基因組基因表達的影響;(2)諸葛菜rRNA基因的不同顯性程度對附加系基因表達的影響;(3)不同附加系基因表達的異同點。主要結(jié)果如下:
　　1.細胞學研究表明1、4、S號附加系含兩條諸葛菜染色體，6號含一條諸

3、葛菜染色體。RNA-seq與生物信息分析發(fā)現(xiàn)4號附加系基因表達改變程度最大，差異表達基因數(shù)為1號和S的1.5倍，為6號的2.5倍，6號改變最小。
　　2.甘藍型油菜中來自于C基因組的差異表達基因數(shù)比A基因組多，但是相對于整體基因組基因總數(shù)來說，A基因組基因的表達更易受到附加諸葛菜染色體的影響。在A、C基因組的三個亞基因組中(LF—the least fractionated blocks，MF1—themedium fractio

4、nated blocks，MF2—the most fractionated blocks)，MF1基因表達受到的影響最大，MF2的最小。
　　3.各個附加系中甘藍型油菜每條染色體上基因表達的差異顯示，不同的諸葛菜染色體傾向性地影響不同甘藍型油菜染色體的基因表達，引起染色體某一區(qū)段內(nèi)大量基因的同方向性差異表達。核仁顯性特異影響A5和C5染色體上基因的表達。
　　4.四個附加系DEGs的功能主要包括細胞組分、胞內(nèi)成分、胞內(nèi)細胞