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文檔簡(jiǎn)介
1、第一部分 miR-182等在前列腺癌樣本中表達(dá)的驗(yàn)證
目的:本研究通過(guò)研究microRNA聯(lián)合篩查與前列腺癌診斷的關(guān)系,為探索前列腺癌發(fā)生發(fā)展的可能生物學(xué)機(jī)制提供理論依據(jù),同時(shí)為篩選前列腺癌相關(guān)可能的潛在生物分子標(biāo)記物及優(yōu)化臨床診斷的實(shí)施提供更有效的指導(dǎo)
方法:用RT-qPCR對(duì)前期篩選出來(lái)的五個(gè)miRNA在前列腺癌組織中和癌旁組織中的表達(dá)進(jìn)行測(cè)定,然后用SPSS軟件對(duì)這五個(gè)miRNA進(jìn)行聯(lián)合診斷分析。
結(jié)
2、果:通過(guò)RT-qPCR對(duì)前期數(shù)據(jù)挖掘分析出來(lái)的有五個(gè)miRNA的表達(dá)進(jìn)行測(cè)定,我們發(fā)現(xiàn)miR-182-3p、miR-182-5p、miR-200c在前列腺癌癥組織中相對(duì)于癌旁組織表達(dá)上調(diào),miR-182-5p上調(diào)最明顯(p=0.0018),其次是miR-200c(p=0.0031)和miR-182-3p(p=0.005);miR-211-3p和miR-221-5p在前列腺癌癥組織中相對(duì)于癌旁組織表達(dá)下調(diào),miR-221-3p下調(diào)最明顯(
3、p=0.0088),其次是miR-221-5p(p=0.0319)。五個(gè)miRNA進(jìn)行ROC聯(lián)合診斷得到的AUC曲線下面積為1。
結(jié)論:我們研究發(fā)現(xiàn)在中國(guó)人群前列腺癌樣本中,miR-182-3p,miR-182-5p,miR-200c的表達(dá)相對(duì)于癌旁組織上調(diào),并且miR-182-5p上調(diào)最顯著;miR-221-3p和miR-221-5p的表達(dá)下調(diào),下調(diào)最顯著的是miR-221-3p。通過(guò)ROC聯(lián)合診斷進(jìn)一步說(shuō)明這五個(gè)miRNA
4、有可能作為前列腺癌聯(lián)合篩查的標(biāo)志物。
第二部分 rs2016347位點(diǎn)多態(tài)性對(duì)結(jié)合miR-3175的影響
目的:為了探究位于IGF1R基因3'UTR與前列腺癌(prostate cancer,PCa)相關(guān)的多態(tài)性位點(diǎn)rs2016347通過(guò)改變與miRNA結(jié)合影響PCa的風(fēng)險(xiǎn)。
方法:本研究用miRbase等生物信息學(xué)工具預(yù)測(cè)靶向miRNA,然后用熱力學(xué)模型方法計(jì)算結(jié)合能情況,最后用雙熒光素酶報(bào)告基因技術(shù)對(duì)H
5、EK293T在體外檢測(cè)改變r(jià)s2016347位點(diǎn)對(duì)靶向miRNA結(jié)合的影響。
結(jié)果:miRbase等工具預(yù)測(cè)結(jié)果顯示,miR-3175與IGF1R的結(jié)合區(qū)位于多態(tài)性位點(diǎn)rs2016347。熱力學(xué)模型方法計(jì)算結(jié)果表明,相對(duì)位點(diǎn)G,hsa-miR3175與IGF1R的3'UTR端在rs2016347位點(diǎn)T上更能有效結(jié)合。雙熒光素酶報(bào)告基因的檢測(cè)結(jié)果顯示,miR-3175能與帶有rs2016347等位位點(diǎn)(G或T)IGF1R3'UT
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